目前该病的确切病因仍不清楚，西医认为重症肌无力可能与机体自身免疫状况有关，已经研究出来的是所有患者的血内都有异常的抗体。
中医认为重症肌无力属于痿证的范畴，主要原因如下：
1、先天不足：人自受精开始，来自父母的先天精气不足，在孕育的过程中又由于各种原因吸收的精元物质不足，如母体营养不良、患病、久病、接受外科手术，或有不良嗜好等导致出生时就是精气不足的体质。这为以后的发病埋下了伏笔。有的甚至一出生就患病，或者10岁以下就患病。
2、后天失养：出生后，在后天的成长过程中，由于营养不良，脏腑、经络、骨骼、肌肉得不到应有的濡养，出现发育不良；作息不规律，过度的劳累（包括过度的工作，过度的性生活等），机体得不到有效的休息；饮食不慎，致吐泄过多，耗伤津液；七情不调，生活学习工作过程中，不能很好的畅调情绪，致使五志过极化火，损伤人体正气。长久以往，导致脏腑、经络、形体出现严重的供养不足。
3、情绪不佳：长期存在负面情绪，如焦虑、抑郁、情绪低落容易导致重症肌无力。另外，工作压力大、学习压力大也容易导致重症肌无力。门诊上常遇到因学习紧张、工作劳累而出现重症肌无力的患者，有朝轻暮重的特点；
4、外感六淫邪气：部分人由于体质差，经常出现各种感染；或直接受过外伤如车祸、刀刃、虫兽咬伤；或患有大病、重病、久病，又加上失治误治，或经历大的手术，病后又失于调养，导致脏腑经络形体供应不足或直接受损。
5、饮食摄生不慎：女性由于妊娠、流产次数太多；或孕龄期月经不调，更年期出现崩漏，导致血不循经，元气大伤；或有不良的嗜好，如吸烟，酗酒，不洁性生活等；或服用某种药物等导致正气虚损，脏腑经络形体供应不足或直接受损，从而诱发重症肌无力。